内水面試験場では、外見から琵琶湖産アユと海産アユを見分ける方法を調べています。
　平成12年度の調査で、人工産アユの違いは、明確になってきたので、河川の現場でも見分けることがある程度可能になりました。（報告書）
　しかし、琵琶湖産アユは、飼育履歴により外部形態に違いが見られたことから、今後も検討していきます。